Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HOXD1Q9GZZ0 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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