Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ZBED3Q96IU2 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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