Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
KNOP1Q1ED39 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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