Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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RTN1Q16799 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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RTN1Q16799 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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RTN1Q16799 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTN1Q16799 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
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RTN1Q16799 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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RTN1Q16799 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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RTN1Q16799 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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