Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ME3Q16798 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ME3Q16798 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ME3Q16798 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ME3Q16798 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ME3Q16798 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ME3Q16798 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ME3Q16798 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ME3Q16798 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ME3Q16798 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ME3Q16798 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ME3Q16798 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ME3Q16798 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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