Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLPPQ16740 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLPPQ16740 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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