Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GBX1Q14549 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GBX1Q14549 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.6 ms