Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ITGA9Q13797 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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