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Protein–RNA interactions for Protein: Q13616
CUL1, Cullin-1, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL1
Q13616
Y_RNA.306-201
ENST00000365015
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.312-201
ENST00000365089
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.322-201
ENST00000365151
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.354-201
ENST00000365448
111 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU6-1189P-201
ENST00000383958
107 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.527-201
ENST00000384573
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.650-201
ENST00000459002
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU7-185P-201
ENST00000459215
60 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.777-201
ENST00000516982
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU6-1270P-201
ENST00000517128
108 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
MIR3171-201
ENST00000584270
74 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.771-201
ENST00000598668
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
MIR6515-201
ENST00000619843
57 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.789-201
ENST00000622480
102 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
C9orf84-203
ENST00000374287
4721 nt
APPRIS P3
TSL 5
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.24-201
ENST00000362508
103 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU6-1327P-201
ENST00000365302
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
VTRNA1-3-201
ENST00000365645
89 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU6-1289P-201
ENST00000384431
106 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
SNORA26.6-201
ENST00000391256
115 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
MIR1257-201
ENST00000408490
117 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU2-11P-201
ENST00000459191
187 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
AC002350.1-201
ENST00000490759
375 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
5S_rRNA.15-201
ENST00000611169
127 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.91-201
ENST00000363042
107 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.432-201
ENST00000384087
111 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.572-201
ENST00000384757
98 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
MIR616-201
ENST00000385293
97 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
RNU7-102P-201
ENST00000458948
62 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
AC108740.1-201
ENST00000498629
225 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
AC004148.1-201
ENST00000571506
398 nt
TSL 5
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
AC008608.1-201
ENST00000603910
127 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
AC092634.7-201
ENST00000621022
103 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CUL1
Q13616
Y_RNA.44-201
ENST00000362676
108 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.430-201
ENST00000384081
110 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.518-201
ENST00000384552
113 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.542-201
ENST00000384641
111 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1319P-201
ENST00000390855
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-747P-201
ENST00000390928
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-241P-201
ENST00000391148
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-985P-201
ENST00000410182
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-447P-201
ENST00000410293
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1118P-201
ENST00000410382
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1076P-201
ENST00000410397
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-355P-201
ENST00000410427
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-791P-201
ENST00000410467
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-705P-201
ENST00000410601
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1100P-201
ENST00000410691
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU2-70P-201
ENST00000410718
179 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1190P-201
ENST00000410811
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-860P-201
ENST00000410860
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1217P-201
ENST00000411276
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-785P-201
ENST00000411324
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AC113618.1-201
ENST00000416747
285 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AC137770.1-201
ENST00000504620
530 nt
TSL 3
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AL162730.1-201
ENST00000605734
292 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
U6.90-201
ENST00000614007
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AP001282.2-201
ENST00000616149
309 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
U6.70-201
ENST00000620287
104 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU5E-4P-201
ENST00000364931
120 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-364P-201
ENST00000384387
107 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1228P-201
ENST00000391014
107 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNA5SP261-201
ENST00000410536
106 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MTCYBP6-201
ENST00000441810
138 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNRPGP8-201
ENST00000454064
226 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MTND5P22-201
ENST00000458380
195 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNA5SP94-201
ENST00000516917
108 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU7-156P-201
ENST00000517214
74 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR4282-201
ENST00000583613
67 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
U2.14-201
ENST00000615943
113 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR6717-201
ENST00000622747
73 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AL589743.1-201
ENST00000551932
2712 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR335-201
ENST00000362173
94 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-653P-201
ENST00000363074
106 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.202-201
ENST00000364083
110 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.216-201
ENST00000364205
93 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNA5SP517-201
ENST00000364724
117 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNORD12C-201
ENST00000386307
89 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNORA40.8-201
ENST00000411034
126 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1137P-201
ENST00000517073
99 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AP003327.1-201
ENST00000529684
127 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR5197-201
ENST00000583721
112 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-1309P-201
ENST00000363305
108 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
snoU2_19.4-201
ENST00000364329
80 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.269-201
ENST00000364685
89 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-867P-201
ENST00000364956
107 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.304-201
ENST00000365011
112 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNORA33.2-201
ENST00000365413
134 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
snoU13.18-201
ENST00000459483
104 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-863P-201
ENST00000515989
104 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
RNU6-448P-201
ENST00000517052
107 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR5093-201
ENST00000583199
100 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
AL365205.2-201
ENST00000594586
68 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
uc_338.16-201
ENST00000621804
95 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
MIR376A2-201
ENST00000636782
80 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.42-201
ENST00000362660
108 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNORD44.1-201
ENST00000363202
61 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
Y_RNA.117-201
ENST00000363294
101 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CUL1
Q13616
SNORD118-201
ENST00000363593
134 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
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