Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CBX3Q13185 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CBX3Q13185 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CBX3Q13185 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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