Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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FOXF1Q12946 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
FOXF1Q12946 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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