Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD10P28358 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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HOXD10P28358 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HOXD10P28358 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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