Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRDP23468 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
PTPRDP23468 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms