Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
J3KRW8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
J3KRW8 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
J3KRW8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
J3KRW8 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms