Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
SHISA9B4DS77 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHISA9B4DS77 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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