Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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GPA33Q99795 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
GPA33Q99795 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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GPA33Q99795 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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GPA33Q99795 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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GPA33Q99795 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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GPA33Q99795 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
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GPA33Q99795 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GPA33Q99795 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GPA33Q99795 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
GPA33Q99795 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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