Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCDC47Q96A33 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCDC47Q96A33 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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