Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
C9orf135Q5VTT2 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
C9orf135Q5VTT2 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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