Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CDKN3Q16667 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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