Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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