| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-26-201 | ENST00000365067 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-10-201 | ENST00000365073 | 81 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.327-201 | ENST00000365201 | 102 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-43-201 | ENST00000365503 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-36-201 | ENST00000365629 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA24-201 | ENST00000384096 | 131 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.537-201 | ENST00000384626 | 109 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR499A-201 | ENST00000384903 | 122 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL135790.1-201 | ENST00000427161 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108059.2-201 | ENST00000434626 | 151 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4421-201 | ENST00000578133 | 69 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3129-201 | ENST00000581095 | 76 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRELID3BP2-201 | ENST00000605362 | 201 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115-40-201 | ENST00000606510 | 82 nt | BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.3-201 | ENST00000363205 | 127 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA7.1-201 | ENST00000363750 | 139 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.241-201 | ENST00000364470 | 117 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA1.2-201 | ENST00000365189 | 134 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.542-201 | ENST00000384641 | 111 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ2-201 | ENST00000390535 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006461.1-201 | ENST00000412637 | 326 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-123P-201 | ENST00000458950 | 160 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NMTRQ-TTG12-1-201 | ENST00000467595 | 72 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL133373.1-201 | ENST00000497098 | 94 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA31.4-201 | ENST00000516049 | 129 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD116-25-201 | ENST00000516517 | 92 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107958.3-201 | ENST00000553410 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR7974-201 | ENST00000615835 | 79 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01359-207 | ENST00000634799 | 487 nt | TSL 5 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4251-201 | ENST00000635819 | 61 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP48-201 | ENST00000363969 | 126 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.440-201 | ENST00000384120 | 114 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.5-201 | ENST00000391061 | 128 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC8P-201 | ENST00000408460 | 126 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR1185-1-201 | ENST00000408598 | 86 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-64P-201 | ENST00000411315 | 191 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01866-201 | ENST00000421181 | 201 nt | TSL 3 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P29-201 | ENST00000456396 | 171 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC074198.2-201 | ENST00000508153 | 258 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.410-201 | ENST00000383992 | 113 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA51.10-201 | ENST00000384418 | 136 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCNPP3-201 | ENST00000393579 | 471 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL392103.1-201 | ENST00000447000 | 198 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5197-201 | ENST00000583721 | 112 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL157834.3-201 | ENST00000615543 | 103 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR8070-201 | ENST00000616510 | 88 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC243994.1-201 | ENST00000618627 | 109 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P7-201 | ENST00000632801 | 297 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP162-202 | ENST00000403245 | 5156 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP290-201 | ENST00000309041 | 7616 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR26B-201 | ENST00000362251 | 77 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP264-201 | ENST00000363115 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-84P-201 | ENST00000364200 | 139 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-597P-201 | ENST00000365620 | 102 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1292P-201 | ENST00000383856 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1336P-201 | ENST00000383886 | 109 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1189P-201 | ENST00000383958 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA27-201 | ENST00000384323 | 126 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25-201 | ENST00000384384 | 134 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-768P-201 | ENST00000384683 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR150-201 | ENST00000385048 | 84 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR618-201 | ENST00000385287 | 98 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR758-201 | ENST00000390227 | 88 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-910P-201 | ENST00000390844 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD12-201 | ENST00000391002 | 90 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068338.1-201 | ENST00000565567 | 176 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548AO-201 | ENST00000579992 | 96 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL022345.2-201 | ENST00000606307 | 135 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FTX_2.1-201 | ENST00000618816 | 94 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027335.2-201 | ENST00000624030 | 375 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SENP7-201 | ENST00000314261 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CXADR-202 | ENST00000356275 | 270 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.441-201 | ENST00000384123 | 112 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA75.2-201 | ENST00000391138 | 150 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA75.3-201 | ENST00000391231 | 150 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS29P24-201 | ENST00000486345 | 171 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD79.1-201 | ENST00000516069 | 84 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA70.22-201 | ENST00000517160 | 124 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| RUNX2 | Q13950 | JMJD1C-212 | ENST00000639129 | 7901 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ3-201 | ENST00000390534 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-913P-201 | ENST00000390913 | 95 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA40.6-201 | ENST00000391153 | 128 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL360175.1-201 | ENST00000426547 | 285 nt | TSL 5 BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS23P4-201 | ENST00000487908 | 423 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107027.2-201 | ENST00000512197 | 115 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU7-121P-201 | ENST00000516604 | 62 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3660-201 | ENST00000584845 | 100 nt | BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF260-205 | ENST00000593142 | 4047 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.21 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DENND4A-209 | ENST00000635620 | 5887 nt | TSL 5 BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR103A2-201 | ENST00000362154 | 78 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.393-201 | ENST00000383936 | 102 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR624-201 | ENST00000385217 | 97 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-998P-201 | ENST00000515894 | 101 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.662-201 | ENST00000516028 | 97 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SCARNA15-202 | ENST00000516881 | 127 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-182P-201 | ENST00000516970 | 105 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC019288.1-201 | ENST00000557918 | 224 nt | BASIC | 1.2 | □□□□□ -2.22 | | |