Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ALCAMQ13740 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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ALCAMQ13740 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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ALCAMQ13740 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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ALCAMQ13740 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ALCAMQ13740 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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