Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SGCGQ13326 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SGCGQ13326 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.5 ms