Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NME3Q13232 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NME3Q13232 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NME3Q13232 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NME3Q13232 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NME3Q13232 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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