Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPS1Q13098 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
GPS1Q13098 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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