Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CHD3Q12873 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CHD3Q12873 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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