Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PTPRMP28827 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
PTPRMP28827 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
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