Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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TMOD1P28289 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
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TMOD1P28289 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TMOD1P28289 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TMOD1P28289 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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