Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
VPREB1P12018 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
VPREB1P12018 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms