Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CRXO43186 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CRXO43186 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CRXO43186 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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