Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
C9orf78Q9NZ63 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C9orf78Q9NZ63 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
C9orf78Q9NZ63 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms