Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GTF3C6Q969F1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GTF3C6Q969F1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms