Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHCHD4Q8N4Q1 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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