Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
IMPG1Q17R60 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
IMPG1Q17R60 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms