Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPROQ16827 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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PTPROQ16827 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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PTPROQ16827 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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PTPROQ16827 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPROQ16827 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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