Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TBR1Q16650 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TBR1Q16650 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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