Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RPE65Q16518 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RPE65Q16518 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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