Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAB35Q15286 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB35Q15286 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms