Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IHHQ14623 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
IHHQ14623 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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