Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GTF2H2Q13888 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GTF2H2Q13888 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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