Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
CACNA1SQ13698 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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