Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PRPF4BQ13523 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRPF4BQ13523 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.29
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