Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CBX3Q13185 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CBX3Q13185 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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