Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ECH1Q13011 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ECH1Q13011 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms