Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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FOXF1Q12946 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
FOXF1Q12946 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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