Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRDP23468 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
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PTPRDP23468 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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PTPRDP23468 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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PTPRDP23468 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPRDP23468 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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