Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CLDN9O95484 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
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CLDN9O95484 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CLDN9O95484 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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