Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NPIPB7O75200 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPIPB7O75200 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPIPB7O75200 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPIPB7O75200 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NPIPB7O75200 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms