Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
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