Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX13Q9Y5W8 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX13Q9Y5W8 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.8 ms